平均海拔4000米的青藏高原是我国生态环境最脆弱的地区之一，青藏铁路所经过的地区多为高原草甸地区，受严酷的气候条件限制，植被生长非常缓慢，一旦破坏了就难以恢复。
　　中华环保联合会副秘书长汪冬青在接受记者采访时表示，为使青藏铁路的建设对青藏高原环境的影响得到有效控制，有关部门在建设前认真做好环境影响评价，贯彻预防为主、保护优先的原则，在工程的设计、建设、运营中充分重视环境保护和生态建设工作，并采取了严格措施。据介绍，开工伊始，青藏铁路的建设者严格、全面执行有关法律法规，要求环保设施和主体工程同时设计、同时施工、同时投产。
　　据介绍，青藏铁路全线用于环保工程建设资金将达20亿元，占工程总投资的8%，这在中国铁路建设史上还是首次。
　　西藏自治区党委书记张庆黎日前曾表示，从目前看来，青藏线的开通对生态的影响不大,在运营过程中，也已经采取了一系列符合实际的保护措施。